Významnou chorobou je hnednutie listov marhule, ktoré spôsobuje huba Apiognomia erythrostoma. Napáda listy, letorasty i plody. Zvlášť náchylné sú odrody Veľkopavlovická, Maďarská, Bergeron, Pinkcot a Orangered. Ochrana sa vykonáva preventívne približne týždeň po odkvete a vhodné je opakovať postrek 2 až 3 krát po 7 až 14 dňoch. Vhodné prípravky sú Baycor 25 WP, Mancozeb (oba pôsobia aj kuratívne do 72 hodín) a Talent.